上海某公司到湖南收购了一份干辣椒，价值8万元，准备用于出口。因收购时没有组织好运输，故在当地与湖南某储运公司签订了一份仓储合同，约定上海公司将该批干辣椒在湖南公司仓库存放7天（5月10日至16日），待原告派车来运。公司支付了仓储费后即回去组织车辆来运。没想到从5月11日开始，湖南连下暴雨，由于仓库年久失修，暴雨形成的积水将库存货物严重浸湿，等上海公司前来提货时，辣椒已变质。湖南仓库以遭受不可抗力为由拒绝进行赔偿。

本案应当如何处理？